近日，湖南大学联合中国医学科学院系统医学中心苏州系统医学研究所、中国疾病预防控制中心，在国际权威期刊Cell Host & Microbe在线发表题为“Genome Composition and Divergence of the Novel Coronavirus(2019-nCoV) Originating in China”的研究论文，揭示新型冠状病毒（2019-nCoV）的基因组构成和蛋白序列水平与2003年爆发的SARS病毒之间存在差异。
该论文共同第一作者为：苏州系统医学研究所吴爱平研究员、湖南大学生物学院彭友松副教授、中国疾控中心黄保英副研究员、苏州系统医学研究所丁啸副研究员。
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该研究对2019-nCoV已确定的三个基因组和相关冠状病毒的基因序列进行比较，其中包括1008条人SARS冠状病毒序列、338条蝙蝠SARS样冠状病毒序列和3131条人中东呼吸综合征（MERS）冠状病毒序列，发现这三株2019-nCoV病毒的基因组序列几乎相同（约29.8kb核苷酸的基因组中只有5个核苷酸差异），与蝙蝠SARS样冠状病毒的关系比与人SARS冠状病毒或人类MERS冠状病毒更为相近。
该研究发现，该新型冠状病毒至少编码27种蛋白质，其中包括15种非结构蛋白（nsp1到nsp10，nsp12到nsp16）、4种结构蛋白（S、E、M和N）和8种辅助蛋白（3a、3b、p6、7a、7b、8b、9b和orf14）。
2019-nCoV与SARS-CoV虽相似，但在编码的蛋白上存在一些显著差异。例如，在SARS-CoV中存在8a蛋白，而在2019-nCoV中不存在；8b蛋白在SARS-CoV中有84个氨基酸，但在2019nCoV中更长，有121个氨基酸；3b蛋白在SARS-CoV中有154个氨基酸，在2019-nCoV中较短，只有22个氨基酸。这些差异可能影响2019-nCoV的功能和发病机制，亟待进一步研究。
2019-nCoV的基因组组成和系统发育树
研究者进一步分析发现在2019-nCoV与SARS和SARS样病毒的氨基酸序列之间存在380个氨基酸的差异，比如在S蛋白上，2019-nCoV相对于SARS-CoV在直接与人类受体ACE2蛋白相互作用的受体结合基序中不存在氨基酸替换，但是RBD（受体结合区）的其他区域发生了6个氨基酸替换。这些氨基酸水平差异可能有助于揭示2019-nCoV与SARS病毒在传染性和致病力上的潜在差异。
SARS和2019-nCoV病毒的氨基酸差异位点
来源：中国医科院系统医学中心苏州系统医学研究所 宣传部
记者：蒋鼎邦
责任编辑：蒋鼎邦
