2月12日，湖南大学联合苏州系统医学研究所、中国国家流感中心和中山大学等单位，成功开发基于分子标记物的流感病毒表型预测平台FluPhenotype，并在国际生物信息学专业权威期刊《Bioinformatics》发表题为“FluPhenotype-a one-stop platform for early warnings of the influenza A virus"的文章进行相关介绍。该文章的第一作者为湖南大学生物学院硕士研究生卢聪毓和博士研究生蔡泽娜，通讯作者为湖南大学生物学院副教授彭友松与苏州系统医学研究所蒋太交教授。
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研究人员通过整合流感病毒核苷酸和氨基酸水平的分子标记物，以及基于分子标记物的抗原和宿主等预测模型，开发了快速预测流感病毒的抗原、宿主、致病性、耐药性等多个表型的预测平台FluPhenotype。（网址：http://www.computationalbiology.cn:18888/IVEW）
平台FluPhenotype
FluPhenotype平台的输入为流感病毒的基因组或者蛋白序列，将自动从基因组或者蛋白序列中抽提分子标记物和序列特征进行病毒表型的预测，输出对于流感病毒的抗原特征、潜在感染宿主、对于哺乳动物的致病性以及对于抗流感病毒药物的耐药性等四个方面的表型，为综合评估该病毒发生和播散的风险提供科学依据,有助于新发突发流感病毒的预测预警。
论文链接：
https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa083/5734644?guestAccessKey=21482286-0b4f-4c8c-9727-9bf1a19ef4b4
来源：宣传部 生物学院
记者：蒋鼎邦
责任编辑：蒋鼎邦
